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由熊廷弼想到了楊漣，朱由檢詢問道：
“楊漣、左光鬥等人的案子怎麼樣了？”
“魏逆逮捕他們，是說他們收受楊鎬、熊廷弼的賄賂，這件事查清了嗎？”
劉僑回道：
“熊廷弼和楊漣雖然都是湖廣人，兩人關係卻很差。”
“熊廷弼在遼陽的時候，楊漣就上疏參劾他。”
“魏逆說楊漣收受楊鎬、熊廷弼的賄賂，純屬子虛烏有。”
熊廷弼被殺有閹黨的責任、也有東林黨的一份，這點朱由檢是知道的。
當初三法司會審，主審的時任刑部尚書王紀、左都禦史鄒元標、大理寺卿周應秋。除了周應秋這個閹黨外，王紀、鄒元標都是東林黨。正是這三個人，把熊廷弼、王化貞都判處死刑。
因此聽到劉僑這些話，朱由檢麵色沒有一點改變。思索之後，下令道：
“兩人案情有關，那就並案處理，以後一同平反。”
“他們都是閹黨謀害的，都要予以翻案。”
這個決定，讓劉僑等人心中驚訝，猜測皇帝的用意。
熊廷弼雖然被閹黨列入東林黨，其實卻是屬於楚黨，是楊漣參劾的對象。兩人案子合並，而且一同平反，不知道內情的，還以為兩人是一黨。實際上楊漣最被東林黨誇讚的兩件事，一是移宮、二是彈劾熊廷弼。
皇帝以案情相關為由，把兩人的案子合並。東林黨人知道了，還不像吃了個蒼蠅：
咽吧不想咽下去，吐又吐不出來。
皇帝是在警告東林黨，還是想說什麼？
朱由檢其實就在警告東林黨，讓他們不要鬨事。