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朱由檢讓孫承宗擔任遼東督師的原因很簡單，這個人能壓住場子，而且能做實事。
當年遼東潰敗之後，楊鎬、熊廷弼、袁應泰、王化貞等遼東大員或是死難，或是下獄。朝臣廷推解經邦為遼東經略，解經邦畏難推卻，遭到削籍處分。
廷臣再推王在晉，王在晉也苦苦推辭，又恐怕步解經邦後塵，不得已而赴任。
到了山海關後，王在晉先是消極退守，被人們譴責“意欲棄關以捐重任”。又在輿論壓力下，不得不建築重關，理由是“外關破，內關尚可守。”
袁崇煥、沈棨、孫元化極力反對，爭論不下，請求朝廷裁斷。時任內閣首輔葉向高認為不可臆斷，應當到現場查勘後決定，兵部尚書兼東閣大學士孫承宗自請前往查勘。
到了遼東之後，王在晉建造重關的計劃，經過激烈爭論遭到否決。但是關門的防守大計依然懸而未決，遼東巡撫閻鳴泰主張守寧遠衛東南的覺華島，寧前兵備袁崇煥主張守寧遠衛，遼東經略王在晉主張守靠近八裡鋪的中前所——
三位遼東文臣，仍然爭執不下。
孫承宗回朝之後，當麵向天啟皇帝陳述方略，極言王在晉不足倚，但勤瘁可念，當改任他職。
天啟皇帝當即召還王在晉，改任南京兵部尚書。然後吏部等衙門會推遼東經略，擬有閻鳴泰、李三才、王之寀、王之臣四位候選人。
群臣爭論不休，孫承宗認為當前最重要的是理順遼東局勢，自請赴山海關督師。訓練兵馬、調和文武，然後選擇可以托付大事者，出任經略、巡撫。
天啟皇帝龍顏大悅，當即下旨，孫承宗以內閣大學士兼兵部尚書的身份，督理關城及薊遼、天津、登萊各處事務，“俟功有次第，即召還朝”——
遼東督師一職，由孫承宗而始。
孫承宗離京的時候，天啟皇帝親自禦門臨遣，賜尚方劍坐蟒，命百官吉服入朝，閣臣送至崇文門外。一切都仿照裴度赴淮西時，唐憲宗禦通化門慰勉的舊事。自裴度以來，相臣出鎮，臨遣賜鉞之禮，沒有像孫承宗這樣隆重的。